工藤新一是一名高校二年級的學生，經常屢破奇案。有一天，新一目睹兩個黑衣人恐嚇別人，他正想阻止罪行之時，卻被另一個黨羽伏擊，且被強迫服下毒藥。新一雖大難不死， 但身體卻縮小到像小學生般。為了隱藏身份，新一利用「江戶川柯南」這個假名，並寄居於毛利偵探事務所，繼續追查秘密組織的底細……柯南的偵探生涯就此展出。
 
第十四話　吸血殭屍山莊兇殺案(下)
第十五話　陣陣花香的兇殺案
第十六話　銀行劫匪住院案
第十七話　可怕的行山兇殺案(上)
第十八話　可怕的行山兇殺案(下)
第十九話　雪女傳說兇殺案
第二十話　小五郎約會日的兇殺案
第二十一話　被趕入絕路的名偵探－兩大連環殺人事件（第一集）
第二十二話　被趕入絕路的名偵探－兩大連環殺人事件（第二集）
第二十三話　被趕入絕路的名偵探－兩大連環殺人事件（第三集）
第二十四話　被趕入絕路的名偵探－兩大連環殺人事件（第四集）
第二十五話　訣別的紅酒迷離兇殺案
第二十六話　名陶瓷家兇殺案（上）